Создание репозитория для нового проекта:

ln -s /media/user/usbdisk/git /home/user/work/usbdisk/git
git --bare init /home/user/work/usbdisk/git/project.git
cd /home/user/work/projects
git clone /home/user/work/usbdisk/git/project.git
cd project
git remote set-url usb file:///home/user/work/usbdisk/git/project.git/

Добавление нового удалённого репозитория к существующему проекту:

ln -s /media/user/usbdisk/git /home/user/work/usbdisk/git
git --bare init /home/user/work/usbdisk/git/project.git
cd /home/user/work/projects/project
git remote add usb file:///home/user/work/usbdisk/git/project.git
git push --set-upstream usb master